Die Insel Neuwerk bietet Vogelliebhabern ein wahres Paradies. Die verschiedenen Vogelarten, die hier im Laufe des Jahres zu beobachten sind, ziehen Ornithologen und Naturliebhaber gleichermaßen in ihren Bann. Besonders interessant ist das Frühjahr, wenn tausende von Ringel- und Weißwangengänsen auf Neuwerk Rast machen, um sich für ihren Weiterflug in die sibirischen Brutgebiete ein Fettpolster anzufressen. Während dieses Spektakels bietet das Nationalpark-Haus von April bis Mai im Rahmen der „Gänsewochen“ ein spezielles Veranstaltungsprogramm an, bei dem Sie die verschiedenen Vogelarten kennenlernen und einen Einblick in das Geheimnis des Vogelzählens erhalten. Im Ostvorland der Insel brüten zudem rund 450 Brutpaare der seltenen Brandseeschwalbe, die seit 2006 auf Neuwerk heimisch ist. Das Wattgebiet um Neuwerk und Scharhörn hat darüber hinaus überregionale Bedeutung als Mausergebiet für Brandgänse.
Schutzmaßnahmen und erfolgreiche Bestandserholung haben dazu geführt, dass die Brut- und Rastvögel im Vorland der Insel Neuwerk wieder zunehmend vielfältig sind. Insgesamt sind hier über 2000 Brutpaare von Flussseeschwalben und zahlreiche weitere Vogelarten vertreten. Zu den wichtigsten Schutzmaßnahmen zählten die Ausweisung als Naturschutzgebiet Neuwerk/Kleiner Vogelsand im Jahr 1982 und die Erweiterung des Schutzgebietes sowie die Ausweisung des Nationalparks Hamburgisches Wattenmeer im Jahr 1990.
In den Salzwiesen und im Vorland der Insel sind zahlreiche weitere Brutvögel zu finden, wie Sandregenpfeifer, Rotschenkel, Austernfischer, Kiebitz, Feldlerche und Wiesenpieper. Der Austernfischer ist dabei der Charaktervogel Neuwerks schlechthin und sein auffälliges Balzverhalten sowie seine aggressive Gelegeverteidigung machen einen Spaziergang durch das Vorland zu einem unvergesslichen Erlebnis. Während der Zugzeiten im Frühjahr und Herbst wird das Vorland zu einem wichtigen Rastplatz für durchziehende Vögel, wie zum Beispiel Ringelgänse und Pfeifenten. Auch Singvögel nutzen das Vorland als Rastplatz auf ihrem Zug.
Die Nationalpark-Verwaltung bietet darüber hinaus verschiedene Führungen an, bei denen Sie die Neuwerker Vogelwelt kennenlernen können, wie zum Beispiel die Führung „Wer brütet auf Neuwerk?“ von Mai bis Juni. Bei einem Spaziergang über die Insel werden Ihnen die Neuwerker Lebensgemeinschaft von Austernfischern, Säbelschnäblern, Brandgänsen, Seeschwalben und Möwen mit ihrem Nachwuchs vorgestellt. Für diese Führung sollten Sie festes Schuhwerk und, falls vorhanden, ein Fernglas mitbringen. Eine weitere Führung, die von August bis Oktober stattfindet, ist die „Rückkehr der Zugvögel“. Während dieser Führung erleben Sie die Rückkehr der Zugvögel aus ihren arktischen Brutgebieten auf dem Weg in den Süden. Seien Sie dabei, wenn Alpenstrandläufer, Pfuhlschnepfen oder Knutts in großen Schwärmen im Wattenmeer landen. Auch für diese Führung sollten Sie festes Schuhwerk und, falls vorhanden, ein Fernglas mitbringen.
Ein Besuch der kleinen Vogelinsel Scharhörn ist nach vorheriger Anmeldung beim Vogelwart und nur bei Niedrigwasser erlaubt und verspricht ein besonderes Erlebnis. Nach einem etwa 7 km langen Wattweg erreichen Sie die Insel und können über den Bohlenweg zum Pfahlbau spazieren, von dem aus Sie den Blick über die Vogelkolonien und weiten Wattflächen schweifen lassen können. Der Vogelwart informiert Sie gerne über die Besonderheiten der Vogelwelt, die Geschichte der Insel und über sein ungewöhnliches Leben auf diesem „Außenposten“ im Wattenmeer. Nach etwa einer Stunde muss der Rückweg angetreten werden, da ein Aufenthalt über eine Hochwassertide nicht gestattet ist.